2022年以来,学院新增科研项目191项,总经费1.25亿元,其中,新增纵向项目102项,经费7700万元,新增横向89项,经费4770万元。近三年学院师生共发表论文369篇,其中中科院一区和二区期刊121篇。
学院已建成生态实验中心(由植物形态结构实验室、基础生态实验室、植物生理生态实验室、污染生态实验室、分子生态实验室组成)、环境科学与工程实验中心(由环境监测实验室、环境微生物实验室、环境工程实验室组成)两个基础实验中心。学院现建有省部级科研平台(团队)5个,其中,绿洲生态教育部重点实验室1个,新疆精河温带荒漠生态系统教育部野外科学观测研究站1个,自治区级“新疆矿产资源绿色开发与生态修复协同创新中心”(共建)1个,自治区“干旱半干旱区可持续发展国际研究中心”1个,海外智力为国服务新疆工作基地1个。具备承担国家重大项目所需的研究设施和工作条件。学院在干旱区植物-土壤耦合机制,生物多样性,山地-荒漠-绿洲生态系统过程与适应等领域取得重要研究成果;在国土空间生态修复、碳汇提升、环境污染治理、废弃物资源化利用、环境功能材料等领域形成优势。